1926年1月，建国湘军改编成国民革命军第六军，程潜任军长。
国民革命军第六军，曾先后组成五次：1926年、1927年、1938年、1945年、1948年。
北伐时期
1926年7月， 国民革命军 第六军参加国民革命军 北伐 ，转战 湖南省 北部及湖北南部。9月中，国民革命军攻克 南昌市 ，第六军休整。
1927年1月，第六军在北伐军江右军编成内，从 江西省 直趋 安徽 ，向 南京 进攻。3月，国民革命军攻克南京，第六军休整。
1928年5月，程潜被 李宗仁 扣押，第六军由李明 代理军长，不久，由胡文斗任军长，张 任副军长。该军被迫由湖南开往江西。8月，胡文斗被部下 杀，由张轸代理军长。随后第六军从 湖南 开往江西途中，番号撤销。
中原大战时期
1929年5月，国民革命军第二十师师长 韩复榘 背叛 冯玉祥 ，投靠 蒋介石 ，第二十师被扩编为第六军，韩复 任军长。该军编成后，隶属 国民革命军 第三路军，先后参加讨伐湖北桂系和 中原大战 。
第一次内战
1931年7月，第六军隶属国民革命军 第一军团 。1932年8月，该军驻防 济南市 地区。
抗日战争时期
1937年10月，因应 中国 抗日战争 需要，该军隶属 国民革命军第三集团军 。
1938年1月，韩复榘因抗战不力被蒋介石枪毙，第六军番号撤销。7月，以国民革命军 国民党第五军 第九十三师为基础扩编为第六军，隶属国民革命军第三十二军团。 甘丽 初任军长。该军组成后，即参加 武汉会战 。
1939年，调往 广西壮族自治区 ，改隶第九战区。
1941年，该军改隶 国民革命军第一集团军 。
1943年1月，该军军长 甘丽初 被免职，由 黄杰 任军长，隶属 国民革命军第十一集团军 。
1945年6月，第六军番号撤销。
第二次内战
1945年10月， 青年军 第二〇二师、第二〇四师、第二〇 五师 在重庆重建为第六军。1946年6月，该军由 贵阳 调至江苏徐州地区。1947年，青年军各军番号撤销。
1948年5月， 卫立煌 以青年军第二〇七师、新编第五军第一九五师合编为第六军， 罗又伦 任军长。该军组成后，主要担任 沈阳市 、 抚顺市 、 本溪 地区守备。9月，罗又伦因病去职，由东北剿匪总司令部参谋长 赵家骧 兼任军长。11月3日，在 辽沈战役 中，沈阳解放后，赵家骧潜逃 南京 ，其余全部被歼。12月，第二〇七师师长 戴朴 逃回南京后，重编第六军，戴朴任军长，是月底，重编后的第六军开赴 台北市 、 新竹市 一带整编补充，归 孙立人 督训。1949年春，整编完毕，由戴朴任军长。